Nature:盡早使用大 Panel 檢測以期更好的臨床獲益
時間:2019-12-17 來源:

Nature:盡早使用大 Panel 檢測以期更好的臨床獲益

NGS 技術助力腫瘤患者精準用藥



腫瘤 NGS 檢測的未來發展方向一定是從小 Panel 到大 Panel,臨床藥效的分子標記物將不再局限于單基因、單位點,包含更多基因和位點的 NGS 大 Panel 將是未來分子檢測項目的發展趨勢。NGS 大 Panel 普遍具備以下特點:覆蓋的癌種類型廣,涵蓋的相關基因及其變異形式多,提供的臨床診治建議及其功效提示全。


OncoDiTM 是凡迪基因于 2019 年正式推出的泛癌種基因檢測項目:包含 OncoDiTM160 和 OncoDiTM375 兩款 Panel。其中 OncoDiTM375 大 Panel 采用高通量測序技術檢測 375 個基因的 DNA 序列變異,涉及 3318 個區段,包含 1372 個單堿基變異 / 短片段插入和缺失,342 個外顯子,23 個融合熱區以及 10 個全基因區域。此外,OncoDiTM375 大 Panel 測序范圍還包括 NCCN 指南推薦的 7 個重要融合基因全基因區域,檢測結果包含覆蓋范圍內的所有突變類型(點突變、插入缺失突變、拷貝數變異以及融合突變),從而有機結合常見和罕見驅動基因突變,同時提供錯配修復(MMR)相關基因狀態和腫瘤突變負荷(TMB)等信息,最大化臨床獲益。


具有以下幾個產品特點:


一、以藥物為中心的產品設計


OncoDiTM375 產品以腫瘤精準用藥為核心設計,以藥物可及性為目的,涵蓋全部癌種的用藥信息包括 82 種靶向藥(已納入中國醫保的 39 種,獲得 NMPA 批準的 9 種和獲得 FDA 批準的 34 種)及 39 種化療藥(已納入中國醫保的 37 種和獲得 FDA 批準的 2 種)覆蓋了市場上 98% 的靶向和化療藥物,真正讓患者有藥可及。


二、2.5Mb 超大靶區覆蓋


OncoDiTM375 產品覆蓋 2.5Mb 的靶區范圍,遠高于行業同類產品。其中對基因融合區域專門設計捕獲探針,重點覆蓋共 25 個融合基因,其中包括 7 個關鍵融合基因(ALK/ROS1/MET/RET/NTRK1/NTRK2/NTRK3)的全基因區和 18 個其他常見融合基因的熱點區域,可以一次性檢測常見及罕見融合伴侶,提高了融合基因的檢出率。


三、兼容液體活檢單分子序列標簽技術(UMI)技術


OncoDiTM 采用雙端雙鏈分子標簽技術,結合凡迪自有的 40 萬例樣本降噪基線數據庫可以極大程度降低外周血中低頻噪音干擾,提高了檢出靈敏度和特異性。


四、超大測序數據量


OncoDiTM 產品一直采用超大測序數據量,為檢測準確性提供有力的支撐與保障。


五、TMB 評估


OncoDiTM375 大 Panel 包含 375 個基因,2.5Mb 的靶區,可以精準預測 TMB。

凡迪基因 秉持 “以客戶健康為中心”的企業精神,每一天,我們都在盡我們所能,追蹤全球癌癥治療進展,為每一位接受檢測服務的中國患者以及醫生推薦精準的癌癥個性化用藥解決方案,讓中國患 者沒有難治的癌癥!


腫瘤是一類具有很大異質性的疾病,很少由單一的基因驅動,通常合并有多種突變豐度不同的驅動基因。I-PREDICT 研究采用大 Panel 對經治、難治性晚期腫瘤患者進行分子檢測,并進行個體化的聯合治療。研究中 88% 的患者根據分子突變譜接受了個體化,≥1 個分子匹配治療,可見聯合治療增加了個體化治療人群,可以使更多的患者獲益。



研究證實在臨床實踐中,基于大 Panel 分析所得的分子信息對晚期難治性腫瘤患者進行個體化聯合治療方案是可行的,為未來的腫瘤治療提供了一個新的思路和方向,也提示我們應該盡早的使用大 Panel 檢測,并綜合分子檢測結果,嘗試個體化的聯合治療模式,應對腫瘤的復雜性和異質性,以期取得更好的臨床獲益。


腫瘤是一類非常復雜,具有廣泛異質性的疾病。既往根據單一驅動基因突變匹配單一分子靶向治療的模式,很容易出現復發耐藥,而根據每個患者的分子突變譜進行個體化的聯合治療可能是未來的方向。


近日,Nature Medicine 上發表了一項前瞻性非隨機 I -PREDICT 研究,該研究探索了根據多基因檢測結果為晚期癌癥患者制定個體化聯合治療方案的可行性。


I-PREDICT 研究是一項在兩個中心(加州大學圣地亞哥分校摩爾斯癌癥中心和南達科他州 Sioux Falls 蘇福爾斯大學 Avera 癌癥研究所)開展的前瞻性導航試驗,旨在評估根據晚期惡性腫瘤患者分子譜,及時推薦個體化聯合治療的可行性。


研究對所有符合條件且簽署知情同意的患者均進行二代測序。此外,還盡可能的進行 PD-L1 的檢測、分析 MSI、TMB 結果。基于上述基因檢測信息,為患者匹配個性化的聯合治療。


研究中共 149 例經治、難治性晚期腫瘤患者參加了 I -PREDICT 研究,其中 83 例(56%)患者可進行分析。

在這 83 例接受治療的患者中,73 例(88%)患者根據分子突變譜接受了個體化治療:73 例患者中 67 例(91.8%)患者接受了分子靶向治療,14 例(19.1%)患者根據 PD-L1 陽性、高 / 中等 TMB、MSI-H、CD274(PD-L1)擴增或攜帶≥8 個基因變異(PD-L1 表達狀態、TMB 和 MSI 狀態未知)接受免疫檢查點抑制劑(單藥或聯合其他藥物)治療;4 例(5.5%)患者基于激素受體陽性表達接受激素治療聯合靶向治療。

研究通過“匹配分數”系統對所有患者進行分層(“匹配分數”系統:與后續用藥相匹配的分子變異總數,除以基因異常總數),將匹配分數>50% 的患者定義為高匹配患者(N=28),匹配分數≤50% 者定義為低匹配患者(N=55),未匹配靶向治療的患者定義為匹配分數 =0%(N=10)。高匹配患者接受的治療方案中,藥物種類中位數為 2 種(范圍 1~5 種);低匹配患者接受的治療方案中藥物種類中位數也是 2 種(范圍 1~4 種)。




圖 1.(a)接受至少一種匹配藥物治療的 73 例患者在特定靶點或通路中可干預變異百分比;

(b)28 例匹配分數為>50% 的患者在特定靶點或通路中可干預變異百分比



所有患者隨訪直至疾病進展或治療不可耐受或死亡。中位隨訪時間為 10.8 個月。總體而言,可評估療效的患者中,30% 取得了疾病控制:包括疾病穩定≥6 個月(N=4)、完全緩解(N=1)、部分緩解(N=16)。

研究中患者的匹配率高達 49%(79/149),遠超過其他已知的精準治療研究。

研究者認為研究使用癌癥相關的大 Panel 高通量平行測序對患者進行分子檢測,同時盡可能的進行 TMB、MSI 狀態、PD-L1 表達和 ctDNA 檢測,一次性獲得腫瘤患者的分子全景信息是得到高匹配率的關鍵原因之一。


參考文獻
ason K. Sicklick, Shumei Kato, Ryosuke Okamura, et al. Molecular profiling of cancer patients enables personalized combination therapy: the I-PREDICT study. Nat Med. 2019,(2019-04-22)[2019-05-06].


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